Browsing by Author "Lopes, Cristina"
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- Chitosan coated textiles may improve atopic dermatitis severity by modulating skin staphylococcal profile: a randomized controlled trialPublication . Lopes, Cristina; Soares, José; Tavaria, Freni; Duarte, Ana; Correia, Osvaldo; Sokhatska, Oksana; Severo, Milton; Silva, Diana; Pintado, Manuela; Delgado, Luís; Moreira, AndréBackground: Atopic dermatitis (AD) patients may benefit from using textiles coated with skin microbiome-modulating compounds. Chitosan, a natural biopolymer with immunomodulatory and antimicrobial properties, has been considered potentially useful. Objective: This randomized controlled trial assessed the clinical utility of chitosan-coated garment use in AD. Methods: Of the 102 patients screened, 78 adult and adolescents were randomly allocated to overnight use of chitosan-coated or uncoated cotton long-sleeved pyjama tops and pants for 8 weeks. The primary outcome was change in disease severity assessed by Scoring Atopic dermatitis index (SCORAD). Other outcomes were changes in quality of life, pruritus and sleep loss, days with need for rescue medication, number of flares and controlled weeks, and adverse events. Changes in total staphylococci and Staphylococcus aureus skin counts were also assessed. Comparisons were made using analysis of variance supplemented by repeated measures analysis for the primary outcome. Interaction term between time and intervention was used to compare time trends between groups. Results: Chitosan group improved SCORAD from baseline in 43.8%, (95% CI: 30.9 to 55.9), P = 0.01, placebo group in 16.5%(-21.6 to 54.6); P = 0.02 with no significant differences between groups; Dermatology Quality of life Index Score significantly improved in chitosan group (P = 0.02) and a significant increase of skin Coagulase negative Staphylococci (P = 0.02) was seen. Conclusions: Chitosan coated textiles may impact on disease severity by modulating skin staphylococcal profile. Moreover, a potential effect in quality of life may be considered.
- A comparison between optimization tools to solve sectorization problemPublication . Teymourifar, Aydin; Rodrigues, Ana Maria; Ferreira, José Soeiro; Lopes, CristinaIn sectorization problems, a large district is split into small ones, usually meeting certain criteria. In this study, at first, two single-objective integer programming models for sectorization are presented. Models contain sector centers and customers, which are known beforehand. Sectors are established by assigning a subset of customers to each center, regarding objective functions like equilibrium and compactness. Pulp and Pyomo libraries available in Python are utilised to solve related benchmarks. The problems are then solved using a genetic algorithm available in Pymoo, which is a library in Python that contains evolutionary algorithms. Furthermore, the multi-objective versions of the models are solved with NSGA-II and RNSGA-II from Pymoo. A comparison is made among solution approaches. Between solvers, Gurobi performs better, while in the case of setting proper parameters and operators the evolutionary algorithm in Pymoo is better in terms of solution time, particularly for larger benchmarks.
- Efficacy and safety of chitosan coated garments on atopic dermatitis management: a randomized controlled trialPublication . Lopes, Cristina; Soares, José; Tavaria, Freni; Severo, Milton; Duarte, Ana; Correia, Osvaldo; Pintado, M. E.; Delgado, Luis; Moreira, Andre M.
- Filaggrin gene polymorphism Pro478Ser, but not loss-of-function mutations Mp.Arg501Ter or C.2282del4, relates with atopic dermatitis severity and increased Staphylococcal aureus colonization in adult patientsPublication . Rocha, Liliana; Lopes, Cristina; Fernandes, Susana; Sokhatska, Oksana; Soares, José; Tavaria, Freni; Pintado, M. E.; Moreira, André M.; Delgado, Luís
- Perfil de diversidade da comunidade estafilocócica da pele em doentes com dermatite atópicaPublication . Lopes, Cristina; Soares, José; Tavaria, Freni; Silva, Rosa; Oliveira, Vera; Morgado, José; Delgado, Luís; Pintado, ManuelaIntrodução: A dermatite atópica (DA) é uma doença cutânea crónica imunologicamente mediada em que a maioria dos doentes está colonizada por Staphylococcus aureus (S. aureus) capaz de produzir vários factores de virulência. O S. aureus pode ser cultivado em cerca de 90% das lesões cutâneas e pode colonizar a pele de aspecto morfologicamente normal. Os estafilococos coagulase negativos (SCN) geralmente não produzem toxinas com actividade superantigénica, mas o seu papel patogénico na DA não pode ser excluído. Neste estudo, pretende-se caracterizar a comunidade estafilocócica da pele de doentes com DA e indivíduos saudáveis, assim como identificar factores de virulência nas espécies identificadas. Métodos: Todos os isolados estafilocócicos foram submetidos a análise numérica de factores de virulência. As espécies isoladas da pele de doentes com DA e indivíduos saudáveis foram submetidas a técnicas de identificação molecular por Multiplex-PCR para identificação de bactérias pertencentes às espécies S. aureus, S. epidermidis, S. capitis, S. hominis e S. haemolyticus através de fragmentos específicos de ADN de 700, 124, 208, 806 e 271 bp, respectivamente. Identificação complementar de cada isolado, previamente identificado por Multiplex-PCR e de 22 isolados não identificados foram realizados por sequenciação do gene sodA. Resultados: Nos doentes com DA isolaram -se estirpes de S. aureus, com 71 (36,2%), S. epidermidis com 59 (30,1%) e S. hominis com 54 (27,6%) isolados. Foi analisada a pele de indivíduos -controlo saudáveis com prevalência para o S. warneri com 10 (23,8%) isolados e S. saprophyticus com 9 (21,4%) isolados juntamente com mais seis espécies identificadas, i.e., S. epidermidis, S. aureus, S. capitis, S. hominis, S. haemolyticus e S. lugdunensis. A maioria das espécies de estafilococos foi coagulase negativo (158/238 isolados) e desoxirribonuclease negativos (161/238). Verificou -se maior biodiversidade na pele de indivíduos saudáveis, com 8 espécies identificadas, do que na pele de doentes com DA, com 4 espécies identificadas. Conclusão: Existe uma maior diversidade de espécies estafilocócicas em indivíduos saudáveis comparativamente aos doentes com DA na presente amostra. A predominância de SA na pele de doentes com DA evidencia a sua maior adaptação. A caracterização detalhada e o perfil de virulência para cada doente poderão ser úteis numa terapêutica antimicrobiana individualizada. A relação simbiótica versus antagonista entre os estafilococos comensais e SA deverá ser melhor esclarecida.