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Profiling of the oral cavity microbiota of young adults and the possible influence of their habits
| datacite.subject.fos | Ciências Naturais::Ciências Biológicas | pt_PT |
| dc.contributor.advisor | Rodrigues, Célia Maria Manaia | |
| dc.contributor.advisor | Ferreira, Ana Catarina Morouço | |
| dc.contributor.author | Silva, Maria Inês Leão | |
| dc.date.accessioned | 2023-11-03T17:26:14Z | |
| dc.date.available | 2024-11-01T01:32:26Z | |
| dc.date.issued | 2023-03-23 | |
| dc.date.submitted | 2023-02 | |
| dc.description.abstract | The interest in the human microbiome is increasing in the last years. The oral microbiome includes a broad microbial diversity, related with the environment, physiology, and habits of each individual, impacting their health state. In this study, the prevalence of different bacterial groups in young adults with different daily habits was evaluated. The objective was to understand if the prevalence of major bacterial groups are similar, at the phylum or class level, between individuals or, if they differ if it could be associated with specific behaviours. Since the study aimed to quantify specific taxonomic groups, the technic quantitative polymerase chain reaction was used for that purpose (qPCR). The study focused on saliva samples donated by an anonymous group of 51 young adults, dental medicine students, that filled out a questionnaire about different behaviours and daily habits. The participants, after informed of the objectives and type of study, gave their informed consent to the realization of this study. Based on the extraction of total DNA, the abundance of total bacteria and abundance of the phyla Bacteroidota, Bacillota and Actinomycetota and the classes Gamma- and Betaproteobacteria was assessed. The used primers targeted the 16S rRNA gene, being the sequences specific to different bacterial groups. The abundance of the 16S rRNA gene per volume of sample ranged from 7.3 and 10.0 log ncopies/mL. The phylo Bacteroidota was observed as the most abundant – 6.3 to 9.3 log-units ncopies/mL, in contrast to the Bacillota that presented a lower abundance between 5.5 and 8.1 log-units ncopies/mL. From a set of 19 variables related to personal characteristics and habits that were organized in a binary scale (present/absent or frequently/unusual), it was observable that the sex, consume of antibiotics in the last 12 months, use of chewing gum, onychophagia and biting of pencils or pens were associated with significantly differences in the abundance of some bacterial groups. These differences were most notorious in the cases of Bacillota, Bacteroidota, Actinomycetota and Gammaproteobacteria and sex and antibiotic intake, Betaproteobacteria and CPO and chewing gum use and other bacterial groups and onychophagia and pen biting. Although it is not possible to establish a relation of cause-effect in these associations, it is possible deduce that some specific habits can contribute to shape the oral cavity microbiota. | pt_PT |
| dc.description.abstract | O interesse sobre o microbioma humano tem aumentado nos últimos anos. O microbioma oral inclui uma ampla diversidade microbiana, relacionada com o ambiente, fisiologia e hábitos de cada indivíduo, e com impacto no estado de saúde. Neste estudo, avaliou-se a prevalência de diferentes grupos bacterianos em jovens adultos que reportavam diferentes hábitos quotidianos. O objetivo foi o de compreender se a prevalência de grupos bacterianos maioritários são semelhantes, ao nível de filo ou de classe, entre indivíduos ou, se quando diferiam, tal poderia ser associado com comportamentos específicos. Uma vez que o estudo visava quantificar grupos taxonómicos específicos, optou-se pela técnica quantitativa de reação de polimerização em cadeia (Polymerase Chain Reaction, qPCR). O estudo incluiu amostras de saliva doadas por um grupo anónimo de 51 jovens adultos, estudantes de medicina dentária, que, simultaneamente, preencheram um inquérito sobre comportamentos e hábitos diários. Os participantes foram informados da natureza e objetivos do estudo ao qual deram o seu consentimento. Com base na extração de DNA total, foi quantificada a abundância de bactérias totais e dos filos Bacteroidota, Bacillota e Actinomycetota e das classes Gamma- e Betaproteobacteria. Em todos os casos, o gene 16S rRNA foi o alvo, utilizando-se sequências específicas para diferentes grupos bacterianos. A abundância do gene rRNA 16S por volume de saliva variou entre 7.3 e 10.0 log nº cópias/mL. O filo Bacteroidota foi observado como sendo o mais abundante com 6.3 a 9.3 log nº cópias/mL, sendo o filo Bacillota o que apresentava abundância mais baixa, com 5.5 e 8.1 log nº cópias/mL. De um conjunto de 19 variáveis relacionadas com características pessoais e hábitos diários que foram estruturados numa escala binária (presente/ausente ou frequente/raro), observou-se que o sexo, o consumo de antibiótico nos 12 meses que antecederam o estudo, o uso de pastilha elástica, os hábitos de onicofagia ou de morder os lápis ou canetas estavam associados com diferenças significativas na abundância de alguns grupos bacterianos. Estas diferenças foram mais notórias nos casos de Bacillota, Bacteroidota, Actinomycetota e Gammaproteobacteria e sexo e toma de antibiótico, Betaproteobacteria e CPO e uso de pastilha elástica e outros grupos bacterianos e onicofagia e roer de canetas. Embora não se possa estabelecer uma relação de causa-efeito nestas associações, é possível inferir que alguns hábitos específicos podem contribuir para modelar a microbiota da cavidade oral. | pt_PT |
| dc.identifier.tid | 203355202 | pt_PT |
| dc.identifier.uri | http://hdl.handle.net/10400.14/42963 | |
| dc.language.iso | eng | pt_PT |
| dc.subject | Oral microbiota | pt_PT |
| dc.subject | qPCR | pt_PT |
| dc.subject | Saliva | pt_PT |
| dc.subject | Actinomycetota | pt_PT |
| dc.subject | Bacteroidota | pt_PT |
| dc.subject | Bacillota | pt_PT |
| dc.subject | Pseudomonadota | pt_PT |
| dc.subject | Microbiota oral | pt_PT |
| dc.title | Profiling of the oral cavity microbiota of young adults and the possible influence of their habits | pt_PT |
| dc.type | master thesis | |
| dspace.entity.type | Publication | |
| rcaap.rights | openAccess | pt_PT |
| rcaap.type | masterThesis | pt_PT |
| thesis.degree.name | Mestrado em Microbiologia Aplicada | pt_PT |