Percorrer por autor "Branquinho, Raquel"
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- Bacillus invictae sp. nov., isolated from a health productPublication . Branquinho, Raquel; Sousa, Clara; Osório, Hugo; Meirinhos-Soares, Luís; Lopes, João; Carriço, João A.; Busse, Hans-Juergen; Abdulmawjood, Amir; Klein, Gunter; Kampfer, Peter; Pintado, Manuela E.; Peixe, Luísa V.
- Bacillus invictus SP. Nov., a new species isolated from medicinal products in PortugalPublication . Branquinho, Raquel; Sousa, Clara; Osório, Hugo; Meirinhos-Soares, Luís; Lopes, João; Abdulmawjood, Amir; Klein, Guenter; Pintado, M. E.; Peixe, Luísa V.
- Differentiation of Bacillus pumilus and Bacillus safensis Using MALDI-TOF-MSPublication . Branquinho, Raquel; Sousa, Clara; Lopes, João; Pintado, Manuela E.; Peixe, Luísa V.; Osório, HugoMatrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry (MALDI-TOF-MS) despite being increasingly used as a method for microbial identification, still present limitations in which concerns the differentiation of closely related species. Bacillus pumillus and Bacillus safensis, are species of biotechnological and pharmaceutical significance, difficult to differentiate by conventional methodologies. In this study, using a well-characterized collection of B. pumillus and B. safensis isolates, we demonstrated the suitability of MALDI-TOF-MS combined with chemometrics to accurately and rapidly identify them. Moreover, characteristic species-specific ion masses were tentatively assigned, using UniProtKB/Swiss-Prot and UniProtKB/TrEMBL databases and primary literature. Delineation of B. pumilus (ions at m/z 5271 and 6122) and B. safensis (ions at m/z 5288, 5568 and 6413) species were supported by a congruent characteristic protein pattern. Moreover, using a chemometric approach, the score plot created by partial least square discriminant analysis (PLSDA) of mass spectra demonstrated the presence of two individualized clusters, each one enclosing isolates belonging to a species-specific spectral group. The generated pool of species-specific proteins comprised mostly ribosomal and SASPs proteins. Therefore, in B. pumilus the specific ion at m/z 5271 was associated with a small acid-soluble spore protein (SASP O) or with 50S protein L35, whereas in B. safensis specific ions at m/z 5288 and 5568 were associated with SASP J and P, respectively, and an ion at m/z 6413 with 50S protein L32. Thus, the resulting unique protein profile combined with chemometric analysis, proved to be valuable tools for B. pumilus and B. safensis discrimination, allowing their reliable, reproducible and rapid identification.
- Noite europeia dos investigadores em Armamar: palco da ciência em ambientes ruraisPublication . Branquinho, Raquel; Duarte, Joaquim; Sarabando, Cândida; Damião, Cláudia; Ambrósio, Susana; Barbosa, Joana Cristina; Barbosa, Joana Bastos; Rezende, Lourenço; Carocho, Márcio; Fernandes, Mariana; Marques, Richard; Friães, Sofia; Santos Carvalho, Ana; Teixeira, Bruno; Ribeiro, Daniela; Grosso, Filipa; Duarte, Inês; Teixeira, José Carlos; Saavedra, Maria José; Alvim, Mariana; Lúcio, Marlene; Oliveira, Mónica; Cardoso Santos, Nuno; Cardoso, Paula; Nunes, Paulo; Cruz, Pedro; Bartolomeu, Raul; Cardoso, Ricardo; Ferreira, Sónia; Carvalho, Teresa; Teixeira, Sofia; Fonseca, Joana; Duarte, Hernâni; Sá-Pinto, Xana; Gomes, Joana; Soares, Luís
- Noite Europeia dos Investigadores em Armamar: uma história contada a várias vozesPublication . Branquinho, Raquel; Duarte, Joaquim; Sarabando, Cândida; Damião, Cláudia; Duarte, Inês; Friães, Sofia; Lúcio, Marlene; Santos Carvalho, Ana; Carocho, Márcio; Marques, Richard; Ribeiro, Daniela; Barbosa, Joana Cristina; Fernandes, Mariana; Barbosa, Joana; Carrulo, Sara; Ambrósio, Susana; Sá-Pinto, XanaA primeira edição da Noite Europeia dos Investigadores em Ambientes Rurais – Armamar (NEI-Armamar 2023) marcou um passo importante na promoção da cultura científica neste território rural. Este evento integrou o consórcio internacional SCIEVER – “Ciência para todos: sustentabilidade e inclusão” e demonstrou como a ciência pode ser uma ferramenta poderosa para democratizar o conhecimento, fortalecer o desenvolvimento local e inspirar projetos de cocriação. Com a participação de mais de 200 membros da comunidade, 69 voluntários (incluindo alunos do Agrupamento de Escolas Gomes Teixeira), e 29 cientistas de 9 áreas disciplinares e de 14 instituições, a NEI-Armamar perseguiu três objetivos principais: i. descentralizar a ciência, ii. aproximar investigadores da comunidade local, iii. fomentar a literacia científica. Como legado e prova de impacto do evento foi publicado um livro colaborativo que amplifica 62 vozes de todos os envolvidos — investigadores, educadores, estudantes, autoridades locais, organização e comunidade de Armamar. Disponível em acesso aberto (doi.org/10.48528/vh3d-zx88), o livro documenta esta experiência coletiva, e fomenta um sentimento de pertença e orgulho na comunidade. Além disso, este livro pretende contribuir para promover o conhecimento e aproximar os leitores, que não tiveram a oportunidade de participar no evento, da ciência. Este recurso inspira ainda a replicação de eventos semelhantes em outros contextos rurais e/ou com acesso limitado ao conhecimento científico. O impacto positivo da NEI-Armamar impulsionou ainda a criação da Associação ARMA-Sci, uma rede dedicada a fortalecer o capital científico local e assegurar a continuidade de iniciativas que promovam a ciência como motor de desenvolvimento comunitário. Este trabalho convida comunicadores de ciência a refletir sobre o poder das narrativas colaborativas na descentralização da ciência, no fortalecimento das comunidades rurais e na promoção de maior resiliência e coesão social.
- Noite europeia dos investigadores em Armamar: uma história contada a várias vozesPublication . Branquinho, Raquel; Sarabando, Cândida; Duarte, Inês; Friães, Sofia; Lúcio, Marlene; Santos Carvalho, Ana; Carocho, Márcio; Marques, Richard; Ribeiro, Daniela; Barbosa, Joana Cristina; Fernandes, Mariana; Barbosa, Joana; Carrulo, Sara; Ambrósio, Susana; Damião, Cláudia; Duarte, JoaquimA primeira edição da Noite Europeia dos Investigadores em Armamar representou uma iniciativa-piloto de descentralização e democratização da ciência em contexto rural. Integrado no consórcio internacional SCIEVER, o evento envolveu 207 participantes, 29 investigadores e 69 voluntários, através de uma abordagem de cocriação interinstitucional com parceiros locais e nacionais. A iniciativa teve como principais objetivos: i) descentralizar o acesso à ciência, ii) aproximar investigadores da comunidade local e iii) fomentar a literacia científica. Os resultados incluem a publicação de um livro colaborativo (doi.org/10.48528/vh3d-zx88), que documenta esta experiência coletiva, e a criação da ARMA-Sci, uma ONG dedicada à promoção da literacia científica e à dinamização contínua de iniciativas que assumem a ciência como motor de desenvolvimento. Este trabalho sistematiza os principais impactos do evento e propõe recomendações para a replicação deste modelo noutros contextos rurais, sublinhando o papel das narrativas colaborativas na valorização da ide
- Phylogenetic and clonality analysis of bacillus pumilus isolates uncovered a highly heterogeneous population of different closely related species and clonesPublication . Branquinho, Raquel; Meirinhos-Soares, Luís; Carriço, João A.; Pintado, Manuela; Peixe, Luísa V.Bacillus pumilus is a Gram-positive bacterium with a wide range of attributed applications, namely as a plant growth promoting rhizobacteria (PGPR), animal, and human probiotic. However, a rare putative role in human diseases has been reported, namely in food poisoning or as anthrax-like cutaneous infectious agent. This species is difficult to distinguish from its closely related species on the basis of phenotypic or biochemical characteristics and 16S rRNA gene sequences. In this study, the phylogenetic analysis of gyrB and rpoB gene sequences of a collection of isolates previously identified as B. pumilus, assigned most of them (93%, 38 of 41 isolates) to B. safensis or to the new recently described B. invictae. Moreover, we extended the previously reported recognized habitats of these species and unveiled a human health or biotechnological relevance (e.g. as implicated in food poisoning or PGPR) for them. Additionally, we demonstrated that both B. safensis and B. invictae species encompass a clonally diverse population, which can justify their great adaptation ability to different niches, with evidence of clonal-host specificity