Utilize este identificador para referenciar este registo: http://hdl.handle.net/10400.14/15526
Título: Interactoma da cavidade oral em cancro oral
Autor: Mendes, Carolina Andreia Coelho
Orientador: Rosa, Nuno
Palavras-chave: proteínas da cavidade oral
OralOme
OralCard
interações proteína-proteína
interatómica
cancro oral
OralInt
oral cavity proteins
OralOme
OralCard
protein-protein interactions
interatomic
oral cancer
OralInt
Data de Defesa: Jun-2014
Resumo: Introdução: a cavidade oral é um ecossistema complexo com um papel crucial em processos biológicos como a fala, respiração e digestão, e é influenciada por fatores físicos, químicos, nutricionais e ambientais, refletindo as interações moleculares estabelecidas entre proteínas do hospedeiro e proteínas produzidas pelo microbiota que o coloniza. O cancro da cavidade oral é dos mais prevalentes em todo o mundo e, por este mesmo motivo, a investigação científica tende a desenvolver novas técnicas no sentido de clarificar a fisiopatologia e descobrir novos métodos de diagnóstico, tratamento e prevenção. As ferramentas bioinformáticas desempenham um papel importante nesta tarefa, fornecendo os meios que permitem estabelecer os pares de proteínas interatuantes, ou seja, o interactoma hospedeiro-microbiota em cancro oral. Objetivos: determinar e interpretar, do ponto de vista fisiopatológico, o conjunto de interações entre as proteínas microbianas e do hospedeiro na cavidade oral, no contexto do cancro oral, isto é, identificar as moléculas envolvidas, mas também os mecanismos moleculares em que elas participam. Material e métodos: as proteínas humanas do cancro oral foram submetidas ao OralInt – ferramenta informática que identifica interações moleculares interorganismo na cavidade oral – de modo a estabelecer o interactoma hospedeiro-microbiota. As proteínas com interação foram submetidas ao AgBase com o intuito de verificar os processos biológicos em que participam. Resultados e Conclusão: o conhecimento do Interactoma do cancro oral permitiu verificar quais os eventos biológicos com maior relevância em cancro oral, que poderão estar sob influência do microbiota oral. Algumas das proteínas poderão ser utilizadas para o diagnóstico precoce constituindo um painel de biomarcadores e no tratamento mais direcionado e menos invasivo, formando potenciais alvos terapêuticos.
Introduction: the oral cavity is a complex ecosystem with a crucial role in biological processes such as speech, breathing and digestion, and is influenced by physical, chemical, nutritional and environmental factors, reflecting the molecular interactions established between host proteins and proteins produced by the colonizing microbiota. Oral cavity cancer is one of the most prevalent worldwide and, on that basis, scientific research is needed to develop new techniques to clarify the pathophysiology and discover new methods of diagnosis, treatment and prevention. Bioinformatics tools play an important role in this task by providing the means for establishing the pairs of interacting proteins, which is in this work we considered the host-microbial interactome in oral cancer. Objectives: to determine and interpret, from a pathophysiological point of view, the set of interactions between the host and microbial proteins in the oral cavity, in the oral cancer context that’s, the identification of the molecules involved and the molecular mechanisms in which they participate. Methods: human proteins of oral cancer were submitted to Oralint – software tool that identifies interorganism molecular interactions in the oral cavity- to establish the microbial–host interactome. The proteins with interaction were submitted to AgBase in order to verify the biological processes in which they participate. Results and Conclusion: the knowledge of the Interactome of oral cancer has shown the biological processes with higher relevance in oral cancer, which may be under the influence of the oral microbiota. Some of the proteins may be used for early diagnosis in a panel of biomarkers and more targeted and less invasive treatments, becoming potential therapeutic targets
URI: http://hdl.handle.net/10400.14/15526
Aparece nas colecções:ICS(V) - Dissertações de Mestrado / Master Dissertations
R - Dissertações de Mestrado / Master Dissertations

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